产品介绍
全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的基因组测序,并在此基础上对个体或群体进行差异性分析。全基因组重测序的个体,通过序列比对,可以找到大量的单核苷酸多态性位点(SNP),插入缺失位点(InDel,Insertion/Deletion)、结构变异位点(SV,Structure Variation)位点和拷贝数变异位点(CNV,copy number variation)。应用范围包括群体遗传学研究、临床医药研究、全基因组关联分析、系统进化和人工受选择分析等众多领域。
基于全基因组重测序技术,人们可以快速进行资源普查筛选,寻找到大量遗传变异,实现遗传进化分析及重要性状候选基因的预测。随着测序成本降低和拥有参考基因组序列物种增多,全基因组重测序成为动植物育种和群体进化研究迅速有效的方法。
简化基因组测序技术是对与限制性核酸内切酶识别位点相关的DNA进行高通量测序。 RAD-seq(Restriction-site Associated DNA Sequence)和GBS(Genotyping-by-Sequencing)技术是目前应用最为广泛的简化基因组技术,可大幅降低基因组的复杂度,操作简便,同时不受参考基因组的限制,可快速鉴定出高密度的SNP位点,从而实现遗传进化分析及重要性状候选基因的预测。简化基因组技术尤其适合于大样本量的研究,可以为利用全基因组重测序技术做深度信息挖掘奠定坚实的基础。
全基因组重测序和简化基因组测序技术可广泛应用于变异检测、遗传图谱构建、功能基因挖掘、群体进化等研究,具有重大的科研和产业价值。
技术流程
技术优势
1.大型动植物基因组分析经验丰富,深入挖掘生物群体意义;
2.流程优化,项目周期显著降低;
3.结合公共数据库样品信息联合分析,节省成本;
4.提供基因组数据构建服务,让数据后期利用更加便利。
送样要求
样品类型:DNA或者样品
样品浓度:≥ 30 ng/μl
DNA总量:≥ 2 ug
分析示例
01
SNP突变频谱
02
群体进化树分析
03
样品structure结构图
04
群体多态性分析