产品介绍

宏基因组（metagenome）是指特定环境中全部生物（微生物）遗传物质的总和。宏基因组测序以特定环境中的整个微生物群落作为研究的对象，不需对微生物进行分离培养，而是提取环境微生物总DNA进行研究。其摆脱了传统研究中微生物分离培养的技术限制，在基因组水平解读微生物群体的多样性和丰度,探索微生物与环境及宿主之间的关系。目前，第二代高通量测序技术在宏基因组的研究上已被广泛应用。第二代高通量测序平台具有通量高、准确性高、速度快、信息全等特点，加快了宏基因组测序在鉴定低丰度的微生物群落，挖掘更多基因资源方面的应用。

宏基因组Binning的方法，可以在自然环境样本中有效区分每个菌株基因组信息。Binning即是从微生物群体序列中将不同个体的序列（reads或contigs）分离开的过程。主要用于微生物组的两方面应用：关联分析和单菌组装。

技术流程

技术参数

技术优势

• 不依赖于微生物的分离培养，克服了传统的纯培养方法的技术限制，为研究和开发利用占微生物种类99%以上的未可培养的微生物提供了一种新的途径和良好的策略

• 可以得到环境中丰度较低的，为研究低丰度微生物提供了途径；

• 引入了宏观生态的研究理念，对环境中微生物菌群的多样性、功能活性等宏观特征进行研究，可以更准确地反应出微生物生存的真实状态。

送样要求

样品类型：取样材料或者DNA

样品浓度：30ng/ul

样品总量：≧1ug

分析示例

01

多样本物种分布条形图

02

相关性heatmap图

03

多样本RDA/CCA分析

04

STAMP分析（样本间）

05

基因簇鉴定