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简化基因组测序

产品介绍

简化基因组测序服务包含两种类型建库测序策略,分别为RADRestriction Association site DNA)和GBSGenotyping By Sequencing),两种方法首先都利用限制性核酸内切酶识别基因组相关位点并进行酶切反应,然后对酶切获得的Tag序列进行高通量测序。两者也存在显著区别,GBS由于简化了建库的步骤,所以是一种性价比更高的SNP分型方法,但是获得标记数量显著低于RAD方法。我们可以根据客户研究的特点灵活选用合适的简化基因组方法。

ddRAD分析原理如下图:

简化基因组分析原理图.png


技术流程

1562045809(1).jpg


技术参数


RAD

GBS

ddGBS(双酶切)

DNA总量

1ug

1ug

> 0.5ug

支持内切酶种类

EcoRI, PstI

EcoRI, PstI

EcoRI, PstI, NlaIII组合

测序深度

基因组 > 1x

基因组 > 0.5x

基因组 > 0.25x

周期

30个工作日,个性化分析需要根据实际情况而定

适用研究材料

所有作图群体、自然群体或者BSA极端混池样品


技术优势

  • 大型动植物基因组分析经验丰富,核心技术人员均9年以上项目经验,已发表国际高水平基因组文章20余篇,获得包括中国科学院、中国农业科学院等在内的多家顶级研究机构认可

  • 合理的团队资源配置,完整的基因组学分析整合,可提供包括基因组、转录组、表观遗传学在内的多种组学技术服务及多种高级及定制化组学分析方案。

  • 流程优化,项目周期显著降低;

  • 结合公共数据库样品信息联合分析,节省成本;

  • 提供基因组数据构建服务,让数据后期利用更加便利。


应用范围

分子标记开发、群体遗传分析、遗传图谱构建、QTL定位、全基因组关联分析、群体研究与分子育种领域等等。


示例分析

01

群落structure

简化基因组群落structure.png


02

SNP突变频谱

简化基因组SNP突变频谱.png


03

性状相关侯选区域鉴定

简化基因组性状相关侯选区域鉴定.png


04

遗传图谱连锁群

简化基因组遗传图谱连锁群.png


05

性状关联分析

简化基因组性状关联分析.png

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